Flyplass på Hardangerjøkulen
Tyskarane kom til Finse 30. april 1940, okkuperte hotellet same haust og vart der krigen ut. Hausten 1940 starta dei arbeidet med ein flyplass på Hardangerjøkulen, der også nordmenn vart tvangsutskrivne for å ta del i arbeidet. Kjeldene seier at 600 sekker sagflis vart transportert opp på breen og stampa ned i bresprekkane, og at eit fly av typen Heinkel skal ha landa, men fall i ein bresprekk då det skulle ta av. Flyet vart demontert og frakta bort med jernbanen! Planane om flyplass, som også omfatta lagerrom, opphaldsrom og gangar inne i breen, vart skrinlagde.

Finse bomba av britane
Natt til 18. desember 1940 bomba britane Finse, med påfølgjande bombetokt dagane etterpå. Bomber fall over stasjonsområdet, hotellet, skeisehallen og snøoverbygg og gjorde moderate skader på bygningar og ein roterande snøplog. Ein tysk soldat vart drepen under fjerning av bomber. Mest truleg var bombetokta meint å skapa vanskar for jernbanedrifta.

Teststasjon for flymotorar
Der Finsehytta no ligg vart det i 1941 bygd ein teststasjon for flymotorar og drivstoff for arktiske strok. Tyskarane sitt opphald på Finse, der dei også dreiv opplæring i meteorologi under arktiske forhold, utprøving av vinterutrusting og flytande bomber, gjorde at aktivitetane vart forsøkt halde hemmelege ved pålegg om blending av togvindauga når dei passerte området ved Finse stasjon. Den norske turistforening overtok bygningane ved teststasjonen, og i 1947 opna Finsehytta for gjestar etter ei større ombygging.